MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 9355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015576	AGT	2	6	1930482	1930487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015576	TCGT	2	8	1932330	1932337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_015576	CCG	2	6	1932414	1932419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_015576	GCC	2	6	1932423	1932428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_015576	GGT	2	6	1936211	1936216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015576	ACC	2	6	1936968	1936973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_015576	GTT	2	6	1938171	1938176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_015576	AGG	2	6	1938202	1938207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_015576	CAC	2	6	1938718	1938723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_015576	CCT	2	6	1940426	1940431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_015576	ACC	2	6	1940488	1940493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_015576	CGC	2	6	1940524	1940529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_015576	TCGGC	2	10	1940537	1940546	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4014	NC_015576	CTG	2	6	1941869	1941874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_015576	GCG	2	6	1941892	1941897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_015576	GT	3	6	1941984	1941989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_015576	GC	3	6	1943924	1943929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_015576	ACGC	2	8	1943977	1943984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_015576	CCT	2	6	1944444	1944449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_015576	GACT	2	8	1944464	1944471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_015576	GTCA	2	8	1944476	1944483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_015576	CGT	2	6	1947671	1947676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_015576	CCG	2	6	1947689	1947694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_015576	GAC	2	6	1948385	1948390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015576	AGG	2	6	1948520	1948525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015576	ATGCT	2	10	1950622	1950631	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4027	NC_015576	ACGC	2	8	1951387	1951394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_015576	CG	3	6	1951396	1951401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_015576	ATTC	2	8	1955911	1955918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_015576	TGA	2	6	1955947	1955952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015576	CGG	2	6	1955958	1955963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_015576	GCG	2	6	1955980	1955985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_015576	ACC	2	6	1957628	1957633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_015576	GTC	2	6	1957698	1957703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_015576	CCG	2	6	1960371	1960376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_015576	CGGC	2	8	1960842	1960849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_015576	CCT	2	6	1961408	1961413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_015576	GCC	2	6	1961418	1961423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_015576	CGTG	2	8	1961426	1961433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_015576	CGC	2	6	1961448	1961453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_015576	GCAC	2	8	1961467	1961474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_015576	GGT	2	6	1963749	1963754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015576	CTGA	2	8	1963759	1963766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_015576	GAC	2	6	1963773	1963778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_015576	GCT	2	6	1963812	1963817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_015576	GCG	2	6	1965199	1965204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_015576	ACG	2	6	1966860	1966865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015576	TG	4	8	1966902	1966909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_015576	GTC	2	6	1967482	1967487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_015576	GTC	2	6	1967582	1967587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_015576	CAG	2	6	1967600	1967605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_015576	CGG	2	6	1967653	1967658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_015576	GCCG	2	8	1967667	1967674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_015576	CG	3	6	1967707	1967712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_015576	TCC	2	6	1967713	1967718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_015576	CTG	2	6	1971477	1971482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_015576	A	8	8	1971484	1971491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015576	TGCA	2	8	1971492	1971499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_015576	AT	3	6	1971598	1971603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015576	CAT	2	6	1971644	1971649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_015576	AGA	2	6	1971652	1971657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015576	TTG	2	6	1971658	1971663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015576	ATT	2	6	1971750	1971755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015576	TCA	2	6	1971781	1971786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_015576	GTT	2	6	1971891	1971896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015576	ATC	2	6	1971963	1971968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_015576	CAG	2	6	1972050	1972055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_015576	GGC	2	6	1972308	1972313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_015576	GCC	2	6	1974884	1974889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_015576	GGA	2	6	1974910	1974915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_015576	CTG	2	6	1974924	1974929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_015576	TG	3	6	1974936	1974941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_015576	TCCC	2	8	1974982	1974989	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4074	NC_015576	GC	4	8	1975062	1975069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_015576	T	6	6	1975131	1975136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_015576	TGG	2	6	1975139	1975144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_015576	GCG	2	6	1975179	1975184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_015576	GGGAG	2	10	1975279	1975288	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_015576	CTG	2	6	1976502	1976507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_015576	GCC	2	6	1978320	1978325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_015576	CGG	2	6	1978384	1978389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_015576	TCA	2	6	1978408	1978413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_015576	ACA	2	6	1978453	1978458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_015576	TGT	2	6	1978461	1978466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_015576	ACTT	2	8	1979486	1979493	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4086	NC_015576	GGA	2	6	1979523	1979528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_015576	AGC	2	6	1979630	1979635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_015576	CCG	2	6	1979649	1979654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_015576	TCG	3	9	1979658	1979666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_015576	CGC	2	6	1987471	1987476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_015576	CGG	2	6	1989073	1989078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_015576	CGG	2	6	1989229	1989234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_015576	CA	3	6	1994876	1994881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_015576	CGC	2	6	1996110	1996115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_015576	CGT	2	6	1996151	1996156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_015576	CGG	2	6	1996169	1996174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_015576	CTC	2	6	1998094	1998099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_015576	G	6	6	1998106	1998111	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015576	CGG	2	6	1998155	1998160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_015576	TGC	2	6	1998172	1998177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_015576	GCC	2	6	1998199	1998204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_015576	CGG	2	6	1998885	1998890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_015576	CTGC	2	8	2000691	2000698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_015576	CGA	2	6	2000706	2000711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4106	NC_015576	GTG	2	6	2005315	2005320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_015576	TGA	2	6	2006118	2006123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_015576	CG	3	6	2008131	2008136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_015576	AGC	2	6	2008171	2008176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_015576	CGC	2	6	2008219	2008224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_015576	CGA	2	6	2008265	2008270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_015576	CATCT	2	10	2008294	2008303	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4113	NC_015576	GTT	2	6	2008364	2008369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015576	GT	3	6	2008383	2008388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015576	TGG	2	6	2008390	2008395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_015576	TGTT	2	8	2008400	2008407	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015576	GTT	3	9	2008405	2008413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_015576	GTG	2	6	2008447	2008452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_015576	T	6	6	2008503	2008508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_015576	GGC	2	6	2008545	2008550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_015576	TGG	2	6	2008704	2008709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015576	TTG	2	6	2008750	2008755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015576	CGA	2	6	2008778	2008783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4125	NC_015576	CGC	2	6	2008899	2008904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_015576	GGTA	2	8	2008979	2008986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_015576	AGA	2	6	2008988	2008993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_015576	CAG	2	6	2009014	2009019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4130	NC_015576	AGG	2	6	2009204	2009209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4263	NC_015576	GAT	2	6	2035007	2035012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_015576	GAC	2	6	2035014	2035019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4265	NC_015576	ACGGCG	2	12	2035024	2035035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4266	NC_015576	CGC	2	6	2035084	2035089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4267	NC_015576	GC	3	6	2035094	2035099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4268	NC_015576	CG	3	6	2035206	2035211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4269	NC_015576	CGCTG	2	10	2035272	2035281	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4270	NC_015576	TCG	2	6	2035314	2035319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4271	NC_015576	CGCGA	2	10	2035453	2035462	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4272	NC_015576	GCC	2	6	2035466	2035471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4273	NC_015576	CG	3	6	2037337	2037342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4274	NC_015576	CGC	2	6	2037376	2037381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4275	NC_015576	GCT	2	6	2037392	2037397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4276	NC_015576	CGG	2	6	2037402	2037407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4277	NC_015576	CG	3	6	2038052	2038057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4278	NC_015576	GACC	2	8	2038081	2038088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4280	NC_015576	TGT	2	6	2038138	2038143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4282	NC_015576	ACTG	2	8	2038159	2038166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4283	NC_015576	GC	3	6	2038172	2038177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4284	NC_015576	GCG	2	6	2039706	2039711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4286	NC_015576	AGC	2	6	2039737	2039742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4289	NC_015576	CCCG	2	8	2042857	2042864	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4290	NC_015576	CCT	2	6	2046550	2046555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4293	NC_015576	CGGGC	2	10	2048460	2048469	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4294	NC_015576	GCG	2	6	2048904	2048909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4295	NC_015576	CGA	2	6	2051344	2051349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4296	NC_015576	GGCA	2	8	2052589	2052596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4297	NC_015576	GTT	2	6	2052614	2052619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4300	NC_015576	CGA	2	6	2052761	2052766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4301	NC_015576	TGG	2	6	2052774	2052779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4302	NC_015576	CGG	2	6	2052804	2052809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4303	NC_015576	ACG	2	6	2052908	2052913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4304	NC_015576	GCTTG	2	10	2052934	2052943	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4305	NC_015576	CGT	3	9	2052947	2052955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4307	NC_015576	CCG	2	6	2053018	2053023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4314	NC_015576	GACT	2	8	2054160	2054167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4321	NC_015576	GGCC	2	8	2058025	2058032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4322	NC_015576	TCG	2	6	2058072	2058077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4332	NC_015576	CAGG	2	8	2058477	2058484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4342	NC_015576	CGG	2	6	2064376	2064381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4372	NC_015576	CCGCG	2	10	2074497	2074506	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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4376	NC_015576	CTC	2	6	2078644	2078649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4380	NC_015576	GAG	2	6	2078819	2078824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4384	NC_015576	ACC	2	6	2079156	2079161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4389	NC_015576	GGGCC	2	10	2082781	2082790	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4390	NC_015576	GGT	2	6	2082813	2082818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_015576	CCGG	2	8	2082825	2082832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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